Затем Эдвард заработал степень магистра в Западном резервном университете Кейза (Case Western Reserve University) в исследовании операций (раздел системного анализа) в 1963-м и стал доктором философии (экономика) в Университете Карнеги-Меллона в 1967-м.В период с 1966-го по 1971-й Прескотт преподавал в Университете Пенсильвании (University of Pennsylvania).